Una diferencia, quizas la mas importante de todas, con respecto a cualquier sistema operativo comercial, es el hecho de que es software libre, que quiere decir esto? que junto con el sistema, se puede obtener el codigo fuente de cualquier parte del mismo y modificarlo a gusto. esto da varias ventajas, por ejemplo:
- La seguridad de saber que hace un programa tan solo viendo el codigo fuente, o en su defecto, tener la seguridad que al estar el codigo disponible, nadie va a agregar «caracteristicas ocultas» en los programas que distribuye.
- La libertad que provee la licencia GPL permite a cualquier programador modificar y mejorar cualquier parte del sistema, esto da como resultado que la calidad del software incluido en GNU/Linux sea muy buena.
- El hecho de que el sistema sea mantenido por una gran comunidad de programadores y usuarios alrededor del mundo, provee una gran velocidad de respuesta ante errores de programas que se van descubriendo, que ninguna compañia comercial de software puede igualar.
windows tiene una interfaz que para muchos usuarios es muy intuitiva y en windows vista y 7 tambien resulta ser muy atractiva por los afectos aero que microsoft agrego a estas dos versiones, la interfaz grafica es la diferencia mas grande en cada una de las versiones de windows incluso para muchos usuarios es la unica diferencia.